Декартовые координаты

Задача координат в декартовой форме устанавливается значением COORD=UNIQUE в группе $CONTRL (установлено по умолчанию).

Координаты вводятся следующим образом:

H    1.0     1.0000000000      0.0000000000     -1.0000000000

Где слева направо:

  • Имя атома (может быть любым, но не длиннее 10 символов).

  • Заряд ядра атома (именно по нему GAMESS (US) распознаёт сорт атома).

  • Абсцисса (координата \(X\)).

  • Ордината (координата \(Y\)).

  • Аппликата (координата \(Z\)).

Следующий атом записывается со следующей строки.

Данный формат ввода координат поддерживает все группы симметрии, поэтому при вводе координат нужно ограничиваться вводом только симметрично-уникальных атомов, то есть тех атомов, с помощью которых операциями симметрии, характерными для выбранной группы симметрии, можно восстановить всю частицу.

Например, полную запись координат гексафторида серы:

 $DATA
coordinates example
С1
S 16  0.000  0.000  0.000
F  9  1.546  0.000  0.000
F  9  0.000  1.546  0.000
F  9  0.000  0.000  1.546
F  9 -1.546  0.000  0.000
F  9  0.000 -1.546  0.000
F  9  0.000  0.000 -1.546
 $END

Можно сильно сократить до:

 $DATA
coordinates example
OH
S 16  0.000  0.000  0.000
F  9  1.546  0.000  0.000
 $END

Такое сокращение существенно уменьшает требуемые вычислительные ресурсы.

Важно

Для COORD=UNIQUE существует возможность ввода ввода базисного набора непосредственно после строки координат каждого атома. Кроме того, возможно задавать базисные наборы в виде отдельных групп.

При выборе значения COORD=PRINAXIS (или синонимичного COORD=CART) координаты атомов вводятся в декартовой форме (стиль ввода аналогичен таковому при COORD=UNIQUE для группы симметрии \(C_{1}\)). После этого автоматически определяется, какие атомы являются симметрично-уникальными, и устанавливается группа симметрии.

Внимание

У значения COORD=PRINAXIS отсутствуют преимущества ввода базисного набора, как у значения COORD=UNIQUE.